داستان انیمیشن «مایا زنبوره 3 : به دنبال گوی طلایی»، درمورد یک زنبورعسل کوچک اما پر تلاش به اسم مایا است که به همراه بهترین دوستش بیلی، موفق به نجات شاهزاده خانم مورچه‌ها می‌شود اما در این میان، آن‌ها وارد یک نبرد حماسی میان حشره‌ها می‌شوند و دوستی‌شان نیز مورد آزمایش قرار می‌گیرد.