انیمیشن خانه در سه زمان و مکان متفاوت می گذرد که هر کدام داستان شخصیت های مختلفی را روایت می کند که در نهایت سرنوشت همه آنها در خانه ای مرموز و عجیب به هم گره می خورد. در بخش ابتدایی انیمیشن خانه داستان مرد فقیری به نام ریموند روایت می شود که برای حل مشکلات مالی خود به خانه دعوت می شود، در بخش دوم با قصه موشی مضطرب مواجه هستیم که در تلاش برای بازسازی خانه است و بخش پایانی داستان گربه ای منظم و سخت گیر است که می خواهد مدیریت دقیقی بر خانه داشته باشد.