سال‌ها پس از آنکه شین هایاتا در قامت اولترامن ظاهر می‌شود، اطلاعاتی مهم را در مورد یک خطر بزرگ بدست می‌آورد. این در حالی است که نشانه‌هایی از قدرت‌های مافوق بشری در پسرش شینجیرو نیز بروز پیدا می‌کند و...