این فیلم داستان میکی، یک "قابل جایگزینی" است که در سیاره‌ای دورافتاده به ماموریت اکتشافی فرستاده شده است. "قابل جایگزینی" به انسان‌هایی اطلاق می‌شود که برای انجام ماموریت‌های خطرناک فرستاده می‌شوند، و هر بار که می‌میرند، با یک بدن جدید و حافظه‌ای کامل از تجربیات قبلی دوباره زنده می‌شوند. "میکی 17" شانزدهمین نسخه‌اش را از دست داده و اکنون در حال تجربه هفدهمین زندگی خود است. اما در طول این ماموریت، او شروع به پرسش درباره مفهوم زندگی، مرگ و معنای واقعی وجودش می‌کند و در نهایت با رازهایی درباره خودش و ماموریتی که به آن فرستاده شده، روبرو می‌شود.