فیلم دو پاپ ماجرای دو کشیش است. کاردینال برگوگیو که از هدایت کلیسا ناامید شده است، در سال 2012 از پاپ بندیکت اجازه بازنشستگی می‌خواهد. در عوض، پاپ بندیکت، سخت‌گیرترین منتقد و جانشین آینده خود در رم را احضار می‌کند تا رازی را فاش کند که پایه‌های کلیسای کاتولیک را متزلزل می‌کند.