فیلم نفوذ داستان زنی است که به همراه همسرش به شهری کوچک نقل مکان می‌کند. اما بعد از مدتی، مورد هجوم بیگانه‌ای در خانه خود قرار می‌گیرند و به این ترتیب زندگی آرام آنها دستخوش تغییر می‌شود.