انیمه شورش در توکیو، داستان کای کوگوما، یک هکر نوجوان یتیم است که پس از کمک به گروهی از موتورسواران طرد شده، درگیر پرونده قتلی مرتبط با یک باند مواد مخدر می‌شود، این ماجرا او را به کشف لایه‌های تاریک شهری می‌کشاند که در پس ظاهر آرمانی‌اش پنهان شده است.