در انیمیشن «ماموران مخفی»، ولادیمیر و هکتور، دو مامور مخفی که از هر نظر مخالف یکدیگرند، در حال تلاش برای بازیابی یک ماده فوق سری هستند که توسط دزدان ناشناس به سرقت رفته است…