داستان فیلم «موج انفجار 2»، با وقوع یک انفجار مهیب در حین یک عملیات مهم نظامی رخ می‌دهد؛ زمانی که افسر ویژه خنثی سازی بمب، پون شینگ فونگ، در این عملیات یکی از پاهایش را از دست می‌دهد و تصمیم می‌گیرد که استعفا دهد. سه سال بعد و پس از چندین حمله بمب گذاری شده تروریستی، پلیس به پون مشکوک می‌شود اما نکته جالب اینجاست که پون مدتی در کما بوده و هیچ خاطره‌ای از گذشته‌اش در ذهن ندارد!