چندین سال پس از وقایع فیلم دوم، داستان تا حدودی در ریودوژانیروی برزیل و بخشی دیگر در برلینِ آلمان رخ می‌دهد و منجر به دخالت جادوگران و جهان جادویی در جنگ جهانی دوم می‌شود. با قدرت گرفتن گریندل والد، آلبوس دامبلدور نیوت اسکمندر و دوستانش را به مأموریتی می‌فرستد که منجر به درگیری با ارتش گریندل والد می‌شود و دامبلدور را به فکر وامی‌دارد که تا چه مدت می‌تواند به دور از جنگ و در حاشیه بماند.