انیمیشن راز کلز درباره‌ی پسر بچه‌ای دوازده ساله به نام برندن است که در کلیسای کلز زندگی می‌کند. در حالی که او باید در ساخت یک دیوار محافظ در برابر حمله وایکینگها همکاری داشته باشد با یک هنرمند تصویرگر آشنا می‌شود و در نهایت این آشنایی او را با بزرگترین ترس زندگی‌اش روبرو می‌کند.