در انیمیشن مارهای صحرا می‌بینیم که در کویر دو دسته از مارهای صحرایی زندگی می‌کنند. یک قبیله، مارهای سبز زیبایی هستند که در پناه واحه‌ای در کویر زندگی می‌کنند و توسط انسان‌ها محافظت می‌شوند و مورد احترام آنها هستند، اما دستۀ دوّم مارهایی سمّی هستند که در شن و غبار و گرما زنده می‌مانند و به دست مردمی که در صحرا زندگی می‌کنند شکار و کشته می‌شوند. در ادامه با آجار آشنا می‌شویم؛ مار نوجوانی که همیشه توسط دوستانش مسخره می‌شود و اوا را می‌بینیم که، دختر مار حاکم است و از ازدواج اجباری که پدرش برایش فراهم کرده می‌خواهد فرار کند. آجار و اوا با هم دیدار می‌کنند و به هم علاقه مند می‌شوند. امّا اوا توسط عمر که مارگیری صحرایی بود ربوده می‌شود، و آجار به همراه بهترین دوستش، پیت عقرب، از صحرای بی رحم عبور ‌می‌کند تا اوا را از سرنوشت وحشتناکی که در انتظارش است نجات دهد!