پس از نبرد میان گودزیلا و تایتان ها و زمانی که معلوم می شود هیولاها واقعی هستند، «فرمانروا: میراث هیولاها» داستان خانواده ای را به تصویر می کشد که به دنبال افشای رازهای مدفون آبا و اجدادی خود هستند و میراثی را می جویند که آن ها را به سازمانی مخفی موسوم به فرمانروا ربط می دهد.