در فیلم بیبی جان ساتیا ورما، افسر پلیس ارشد، پس از تهدید خانواده‌اش، هویت جدیدی به نام جان دسوزا انتخاب می‌کند و به همراه دخترش به کرالا نقل مکان می‌کند. او زندگی ساده‌ای به‌عنوان صاحب یک نانوایی آغاز می‌کند و با معلم دخترش، تارا، آشنا می‌شود.با این حال، گذشته ساتیا او را رها نمی‌کند و دشمنان قدیمی‌اش، به رهبری سیاستمدار فاسد بابار شر، او را پیدا می‌کنند و زندگی او و دخترش را تهدید می‌کنند...