گروهی از حیواناتی اهلی که عمر خود را در باغ وحش نیویورک سپری کرده‌اند، پس از وقوع رویداد‌هایی غیرمنتظره، از جنگل‌های ماداگاسکار سر در می‌آورند. در این شرایط، آنها باید به زندگی در طبیعت وحشی عادت کنند اما…