در فیلم «جانوران شگفت‌انگیز و زیستگاه آن‌ها»، نیوت اسکمندر از لندن به نیویورک برای پیدا کردن موجودی جادویی و نادر سفر می‌کند. او همراه خود چمدانی پر از موجودات شگفت‌انگیز جادویی حمل می‌کند. همزمان با ورود او اتفاقات عجیب و غریبی در نیویورک رخ می‌دهد که جامعه جادویی را نگران می‌کند. وزیر سحر و جادو فکر می‌کند این حوادث زیر سر موجودات همراه اسکمندر است…