بعد از رویدادهای انقلاب ماتریکس، نئو با ظاهر عادی تحت هویت اصلی خود به عنوان توماس اندرسون در سان فرانسیسکو مشغول به زندگی است، روانشناسی به او برای مقابله و مبارزه با چیزهای غیرطبیعی و عجیب و غریبی که او گاهی اوقات می بیند قرص های آبی را تجویز می کند.