فیلم تنها بازمانده، داستان واقعی عملیات Red Wings را روایت می‌کند، که در آن چهار عضو نیروهای ویژه نیروی دریایی آمریکا به رهبری مارکوس لوترل، ماموریت یافتند تا یک رهبر طالبان را در افغانستان شناسایی و دستگیر کنند. این ماموریت خطرناک به سرعت به مبارزه‌ای برای بقا تبدیل شد.