داستان این فیلم که سیزدهمین قسمت از مجموعه فیلم‌های پیشتازان فضا و دنبالهٔ فیلم پیشتازان فضا به سوی تاریکی 2013 است، کاپیتان جیمز تی کرک به همراه افرادش از طرف پایگاه ارهارت برای بررسی چندین موضوع سفر خود را آغاز میکنند ولی پس از رخ دادن اتفاقاتی در یک سیاره ناشناخته و عجیب فرود می آیند. آنها متوجه می شوند که با یک بیگانه به نام کرال مواجه هستند که باید یا او را از میان بردارند یا اینکه با او متحد شوند…