فیلم مکعب با به هوش آمدن گروهی از افراد در یک اتاق مکعبی و بی‌در و پیکر آغاز می‌شود. این افراد، که هیچ‌کدام یکدیگر را نمی‌شناسند و به یاد نمی‌آورند چگونه به این مکان آمده‌اند، باید راهی برای خروج از این ساختار پیچیده پیدا کنند. اتاق‌ها به ظاهر یکسان هستند اما برخی از آن‌ها تله‌های مرگباری در خود دارند که جان آن‌ها را تهدید می‌کند. اعضای این گروه شامل افرادی با مهارت‌ها و شخصیت‌های متفاوت هستند. در ابتدا، آن‌ها برای زنده ماندن و پیدا کردن مسیر خروج، تصمیم می‌گیرند با هم همکاری کنند. اما با گذشت زمان و افزایش فشار و استرس، اعتماد آن‌ها به یکدیگر به چالش کشیده می‌شود و تنش‌ها بالا می‌گیرد. هر اتاق مکعبی مانند یک پازل است که باید برای عبور از آن راه‌حلی پیدا کنند، و با هر حرکت اشتباه، یکی از آن‌ها ممکن است گرفتار تله‌های مرگبار شود. با پیشرفت داستان، مشخص می‌شود که هر یک از افراد به دلیلی خاص در این مکعب گرفتار شده‌اند و شاید راه فراری برای آن‌ها وجود نداشته باشد. فیلم با ایجاد فضای ترسناک و پرتعلیق، به بررسی موضوعاتی مانند اعتماد، همکاری، و بقای انسان در شرایط سخت می‌پردازد. پایان فیلم نیز همانند نسخه اصلی، تماشاگران را با سوالات بیشتری درباره ماهیت مکعب و هدف از ساخت آن تنها می‌گذارد.